¿Cómo omitir (intermitentemente) ciertas celdas cuando se ejecuta el cuaderno IPython?

Por lo general, tengo que volver a ejecutar (la mayor parte de) un cuaderno cuando lo vuelvo a abrir, para poder acceder a las variables previamente definidas y seguir trabajando.

Sin embargo, a veces me gustaría omitir algunas de las celdas, que no tienen influencia en las celdas posteriores (p. ej., pueden comprender una rama de análisis que está terminada) y pueden tardar mucho tiempo en ejecutarse. Estas celdas se pueden dispersar por todo el cuaderno, por lo que algo como “Ejecutar todo a continuación” no ayudará mucho.

¿Hay una manera de lograr esto?

Idealmente, esas celdas podrían etiquetarse con algunas banderas especiales, de modo que pudieran “Ejecutarse” manualmente, pero se omitirían cuando “Ejecutar todo”.

EDITAR

%%cache (extensión ipycache) como lo sugiere @Jakob resuelve el problema hasta cierto punto.

En realidad, ni siquiera necesito cargar ninguna variable (que puede ser grande pero innecesaria para las siguientes celdas) cuando se vuelve a ejecutar, solo la salida almacenada importa como resultados de análisis.

Como solución temporal, coloque %%cache folder/unique_identifier al principio de la celda. El código se ejecutará solo una vez y no se cargarán variables cuando se vuelva a ejecutar, a menos que elimine el archivo de identificador_único.

Desafortunadamentetodos los resultados de salida se pierden cuando se vuelve a ejecutar con %%cache…

EDITAR II (14 de octubre de 2013)

La versión maestra de ipython+ipycache ahora también selecciona (y vuelve a mostrar) la salida de la celda de código.

Para salidas de visualización enriquecidas que incluyen Latex, HTML (salida de pandas DataFrame), recuerde usar el método display() de IPython, por ejemplo, display(Latex(r'$\alpha_1$'))

Aunque esto no es exactamente lo que parece estar buscando, si desea omitir por completo la ejecución de una celda (donde no se cargan los resultados almacenados en caché), puede agregar el siguiente truco al comienzo de una celda (suponiendo que está utilizando un sistema operativo basado en Unix):

%%script false

o una variante (en funcionamiento desde principios de 2020; consulte aquí para la explicación):

%%script false --no-raise-error

Actualmente, no existe tal característica incluida en el cuaderno de IPython. Sin embargo, existen algunas posibilidades para facilitarte la vida, como:

• utilizar el %store o tal vez mejor el %%cache magia (extensión) para almacenar los resultados de estas celdas intermitentemente, para que no tengan que volver a calcularse (ver https://github.com/rossant/ipycache)

• Agrega un if==0: antes de las celdas que no desea ejecutar

• convierta estas celdas en celdas sin procesar (¡pero perderá la salida ya almacenada!)

(ver discusión en https://github.com/ipython/ipython/issues/2125)

Aquí hay una solución simple y universal sin necesidad de soluciones alternativas: simplemente escriba esto como la línea superior de la celda para omitir la celda:

%%script echo skipping

Está probado en Windows y Mac con Jupyter reciente, y creo que también debería funcionar en otras plataformas similares a Unix porque también tienen un echo dominio. Algunas de las otras soluciones propuestas son más específicas de la plataforma.

Por supuesto, puedes poner el texto que quieras en lugar de “saltar”. Cuando ejecuta la celda, simplemente imprimirá este texto en lugar de ejecutar el código en la celda.

Si no se espera que se carguen resultados almacenados en caché, encuentro el Freeze nbextension bastante útil para este fin.

Aunque no es oficial, recomiendo encarecidamente probar estas extensiones de portátiles si nunca las ha usado antes.

Para instalar la maquinaria de extensión,

$ pip install jupyter_contrib_nbextensions && jupyter contrib nbextension install

Para habilitar el Freeze extensión, lanzamiento jupyter notebook y abra un nuevo cuaderno, desde el menú, seleccione Edit > nbextensions configy luego verifique Freeze.

Esta pregunta es un poco más antigua, pero parece que falta la respuesta más conveniente. Puede utilizar las ‘celdas de inicialización’ de NBextensions. Una vez instalado/activado, puede marcar celdas en cualquier cuaderno como “celdas de inicialización” que luego se pueden ejecutar con un botón específico.

• Instalar NBextensions:aquí

• Active las ‘celdas de inicialización’ cuando inicie el panel de jupyter

• En su cuaderno, en el menú ‘ver’, elija ‘barra de herramientas de celda’ y luego ‘celda de inicialización’

• Junto a cada celda ahora hay una casilla de verificación. Marque todas las celdas que desea ejecutar para la inicialización
• Al volver a abrir un cuaderno, haga clic en el botón que parece una calculadora de bolsillo para ejecutar todas las celdas de inicialización.

La forma más sencilla de omitir la ejecución del código Python en la celda del cuaderno jupyter, convierto temporalmente esas celdas en rebajas.

El %%script false solución dejó de funcionar en algún momento en 2019.

Aquí hay algunas otras soluciones disponibles. Estos se basan en programas que ignoran sus argumentos cuando les dices que no esperen ninguno. Aquí hay algunos ejemplos fáciles:

Perl:

%%perl -e0
​
for i in range(10): print(i)

Aquí estás ejecutando: perl -e '0' cellcontents

Una versión más memorable:

%%perl -eat
​
for i in range(10): print(i)

Aquí estás ejecutando: perl -e 'at' cellcontents

Intento:

%%bash -c :

for i in range(10): print(i)

: es un no-op en bash, por lo que está ejecutando: bash -c : cellcontents

No he mirado el código de implementación de magia externa, pero estoy bastante seguro de que los “contenidos de celda” se pasan como argumentos y no serán interpretados por Shell por error, digamos si tuviera que incluir ; en ellos e inyectar accidentalmente un código incorrecto. Pero no puedo garantizarte eso.

Estoy seguro de que puede encontrar otras soluciones creativas, mirando los programas compatibles aquí: https://ipython.readthedocs.io/en/stable/interactive/magics.html#cell-magics